治疗脂肪肝的原则是根除病因、科学膳食、坚持体育锻炼、施以中西药等综合措施。
１．病因治疗：
营养过剩性脂肪肝：最为常见。主要方法是控制热量摄入，保证生理需要，饮食上不贪多，不求精；改变饮食结构，要低脂少糖；坚持健身，维持标准体重。
肥胖性脂肪肝：也较常见。与营养过剩密切相关。主要措施是节食减重，但不要操之过急，每年减重１０－２０公斤为宜。生活上合理搭配三大营养素，持之以恒，健身锻炼。
糖尿病性脂肪肝：重点是纠正糖代谢紊乱。在抗糖尿病治疗中坚持目标治疗。糖化血红蛋白＜６．５ｍｍｏｌ／Ｌ；血压控制１３０／８０ｍｍＨｇ左右。
肝炎后脂肪肝：许多肝炎病人在治疗中往往陷入误区，即休息、高蛋白、高糖、高热量的“保肝”措施。正确的应是祛毒护肝，移除脂肪。给予足量的蛋白质、低脂肪、高维生素，适当体育锻炼，促进肝细胞恢复。
２．膳食治疗：
食疗的意义是维持标准体重，摄入适当热量，营养素比例合理，纠正不良饮食嗜好，防治并发症的发生。
１９９７年中国营养学会在《中国居民膳食指南》中指出①食物多样化，以谷类为主；②多吃蔬菜水果；③多用奶类及豆制品；④常吃鱼、蛋及瘦肉，少吃肥肉及荤油；⑤食量与体力活动消耗保持平衡；⑥清淡少盐；⑦戒烟限酒。
《指南》中的意见具有普遍指导意义。
３、体育锻炼：
坚持体育锻炼可以达到增强体质、提高整体性生理效应，增强人体抵抗力和免疫力，精神焕发，体力充沛，改善生活质量，延年益寿，是人所共知的常识。同时锻炼对脂肪肝还有治疗意义，如消耗过剩的能量，降低甘油三酯及血糖；减少脂肪肝出现的倦怠、乏力、气闷等症状，延缓心血管的并发症。总之运动消耗过多热能比减少摄入热能更好更重要。
运动的方式、强度、频率应根据患者的文化程度、病情状况、场地条件、个人爱好、习惯、兴趣，选择适合自己的运动项目、时间、运动量。其原则是参加低强度的全身运动，如慢跑、骑自行车、上下楼、打羽毛球、跳舞、做广播操、游泳、练气功、打太极拳等。
参加体育锻炼的要求应是贵在坚持、循序渐进、运动量由小到大，运动时间由短到长，运动技巧由简到繁。最好是群体锻炼、趣味活动，这样可以彼此交流心得，提高活动质量。
４、药物治疗：
脂肪肝是多种因素导致肝脏脂肪代谢紊乱致使脂肪堆集在肝细胞的结果。市场上治疗脂肪肝的中西药物繁多，但必须明确目前尚无一种公认的特效药物。不要听信夸大疗效的广告商业宣传，但也不要失去信心放弃治疗。
下面一些药物要权衡利弊，轮换使用，对于脂肪肝在阻断病因、护肝移脂、终止发展、促进逆转等方面有所帮助。常用的药物如下：肝得健、益肝灵、肝泰乐、氨基酸、氟磷脂、维生素Ｃ、维生素Ｅ、前列腺Ｅ、吉非罗齐、辛伐他汀、阿托伐他汀、血脂康、脂必妥等。